Como não forneceu o modelo para verificarmos o esquema, verifique os diodos de retificação para o magnetron, algumas vezes ficam com fuga que não se consegue medir e o magnetrao não produz energia suficiente (não coloque o multímetro para medir com o aparelho em funcionamento, atenção à carga dos condensadores quando mexer no aparelho)
Uma outra causa é a membrana isoladora com sujidade, ao fim de muito tempo de funcionamento, a membrana vai ficando com resíduos que impedem a normal passagem física das ondas produzidas pelo magnetrão.