Note que esse ciruito esta feito para simular um semáforo de um cruzamento de ruas.
É normal que se numa rua tem sinal verde na outra rua tem de ter o sinal vermelho.
Claro que entre a mudança de un estado para outo aparece num lado vermelho e no outro amrelo.
O seu circuito se não está a funcionar assim tem algo de errado na sua montagem ou trocou os led vermelho dos semáforos
Repare bem no esquema .
Tem o semáforo 1 e o semáforo 2.
Repare bem nos números dos led .
Troque a posição fisica dos led vermelhos, mas não altere as ligações.
Ver figura